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本网讯（通讯员 孙丛苇）日前，从农学传来好消息，省部共建国家重点实验室陈锋教授团队科研再结硕果。著名植物科学期刊《Plant Biotechnology Journal》刊发了该团队对小麦分子育种领域常用的7款芯片进行系统评估的研究成果。文章题目为《小麦660K芯片在多倍体小麦分子标记选择中有巨大应用潜力》（The Wheat 660K SNP array demonstrates great potential for marker‐assisted selection in polyploid wheat），我校青年教师孙丛苇博士为本文第一作者，陈锋教授为该文通讯作者。
小麦是我国最为重要的粮食作物之一，然而近年来产量和品质的进一步提高遇到了瓶颈，究其原因，主要是常规育种发展到一定阶段，其局限性越来越突出，需要与现代分子生物学技术有机结合才能实现更大飞跃。基因芯片的快速发展和应用在小麦分子育种领域加速了基因组选择及全基因组范围内的连锁与关联分析。尽管基于PCR的分子标记和重测序技术对分子标记辅助选择的贡献巨大，但是随着更为准确、完整的中国春参考基因组的释放，基于不同密度和应用目标的基因芯片越来越多地被开发和利用。
文章系统分析了小麦分子育种领域常见的7款芯片（9K、15K、90K、55K、660K、35K、820K），在芯片SNP数目、分布、密度、关联的基因数、杂合度和应用等方面的分析结果表明，小麦660K芯片包含数目最高的有准确物理位置的基因组特异SNP位点（99.05%）。常用芯片中可靠SNP染色体在小麦不同染色体上的均匀度分析表明，小麦660K芯片在所比较的几款芯片中均匀度最高，几乎没有灰白色区域。进一步分析发现，小麦660K芯片中有229,266个SNP位于66,834（63.52%）个注释基因内或其启动子区域，这些注释基因几乎包含了所有由其他常用芯片检测到的注释基因，包含比例分别为97.44%（35K）, 99.73%（55K）, 86.9%（90K），85.3%（820K），因此，小麦660K芯片在一定程度上可以替代剩余的6款芯片。文章同时还分析了各款芯片的价格及近年来的文章发表利用情况，由此表明小麦660K芯片可靠性好、成效高，可能是近年来小麦分子标记辅助育种的最优选择，并具有广阔的应用前景。
据介绍，这一研究成果的产出建立在与陈锋教授团队长期实践的基础上，并受到国家重点研发计划项目（2016YFD0101802),）、NSFC-国际合作项目（3181101544）和NSFC-河南联合基金重点项目（U1804234）等的资助。
原文链接：The Wheat 660K SNP array demonstrates great potential for marker‐assisted selection in polyploid wheat
编辑：孙淑娥 郭治鹏
